Das Wappen der seit 1798 bestehenden Gemeinde Unterägeri zeigt ein rotes Segelschiff mit einem blauen Segel, auf dem ein weisses Kreuz abgebildet ist. Im Schiff sitzt ein blau gekleideter Steuermann, der keine bestimmte Person darstellt.

Das Wappen geht vermutlich auf Vorlagen des 18. Jahrhunderts zurück. Ein Siegel der alten Gemeinde Ägeri, aus Unter- und Oberägeri bestehend, zeigt zwei Segelschiffe mit Steuermännern. Bei einem der Schiffe ist ein Kreuz auf dem Segel erkennbar. Im 19. Jahrhundert hatte das Unterägerer Wappen unterschiedliche Formen. Meistens zeigte es das Segelschiff im blauen Balken des Zuger Kantonswappens. Seine heutige Gestalt erhielt das Wappen erst im Verlauf des 20. Jahrhunderts.